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生物学论文_基于生信数据库探析NAT1基因在结肠

来源:肿瘤药学 【在线投稿】 栏目:期刊导读 时间:2021-10-26

【作者】:网站采编
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【摘要】:文章摘要:[目的]通过大数据分析了解NAT1mRNA和蛋白质在结肠癌中的表达情况及对临床预后的影响。[方法]检索当前世界上几个主要的肿瘤生物信息数据库(Oncomine、TCGA、CPTAC等)中有关

文章摘要:[目的]通过大数据分析了解NAT1mRNA和蛋白质在结肠癌中的表达情况及对临床预后的影响。[方法]检索当前世界上几个主要的肿瘤生物信息数据库(Oncomine、TCGA、CPTAC等)中有关NAT1的相关数据,对其进行生物信息学分析,对NAT1在结肠癌中的临床作用进行荟萃分析。[结果]443项有关NAT1的不同类型研究结果纳入Oncomine数据库,NAT1表达在肿瘤与其对照组织中有统计学差异的结果有37项,其中NAT1高表达的有12项,低表达的有25项。涉及到结肠癌的研究共有15项,且在结肠癌组织中均为低表达。涉及到NAT1在结肠癌和正常组织中的mRNA表达的样本共有565例。Oncomine数据库中9项研究数据集的二次分析结果表明NAT1在结肠癌中的表达低于正常组织(P <0.05)。TCGA数据库和CPTAC数据库提示NAT1在结肠癌中的mRNA和蛋白水平均呈现低表达(P <0.05)。另外,免疫组织化学显示NAT1在结肠癌组织中表达较弱或呈阴性,而在正常组织中表达较强或中等。NAT1表达和年龄、种族、性别、体重、肿瘤分期无关,而与肿瘤的组织病理分型可能存在一定相关性(P <0.05)。不仅如此,生存分析发现高表达NAT1的患者预后较好(P <0.05)。[结论]NAT1的mRNA和蛋白水平在结肠癌组织中呈现低表达,和结肠癌不良预后相关。

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项目基金:《肿瘤药学》 网址: http://www.zlyxzz.cn/qikandaodu/2021/1026/1566.html

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